על מנת להביא את בריכת הנוי איזון אקולוגי יש צורך בסינון מתמיד של המים. קיימים ארבעה סוגים של מסננים:

*      מסננים ביולוגים

*      מסננים ביולוגים + נורת UV

*      מסנני לחץ

*      מסנני לחץ + נורת UV

יש מספר נקודות חשובות שכדאי לדעת על מסננים. החומרים הביולוגיים במסנן מהווים מצע נוח לגידול חיידקים, שמפרקים חומרים טוקסיים, שנוצרים בבריכת נוי. נורת ה-UV מספקת הגנה נוספת נגד הירוקת ומבטיחה מים צלולים.

את המסנן יש להתאים לגודל הבריכה ולתנאי הסביבה כגון כמות הדגים בבריכה, מידת החשיפה לשמש, כמות נשורת העצים לתוך הבריכה. פעולה חשובה נוספת של המסנן היא לשמור על שלמות המעגל הביולוגי בבריכה. הפרשות הדגים מלוות בהיווצרות רעלן האמוניה במים. החיידיקם שבמסנן מפרקים את הרעלן, שמזיק לחיי הבריכה,  לניטריט ו- ניטרט, שמסייעים לשמירה על האיזון הביולוגי. כדי לשמור על יעילות המסנן יש לוודא שהוא לא יתייבש.